修訂后的農民專業(yè)合作社法共10章74條，對農民專業(yè)合作社的定義和基本原則，設立和登記，成員，組織機構,財務管理,合并、分立解散和清算，農民專業(yè)合作社聯(lián)合社，扶持措施，法律責任等作了規(guī)定。根據(jù)全國人大常委會組成人員的審議意見和各方面意見，新修訂的農民專業(yè)合作社法主要在以下幾個方面作了修改和完善:
(一)進一步完善農民專業(yè)合作社的定義，豐富了農民專業(yè)合作社的服務類型
為適應農民專業(yè)合作社在專業(yè)化生產(chǎn)服務基礎上延伸產(chǎn)業(yè)鏈條、向綜合化發(fā)展的趨勢，新修訂的農民專業(yè)合作社法擴大了農民專業(yè)合作社的業(yè)務服務內容，不再局限于同類農產(chǎn)品或者同類農業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營服務的范圍。新法第二條規(guī)定:“本法所稱農民專業(yè)合作社,是指在農村家庭承包經(jīng)營基礎上，農產(chǎn)品的生產(chǎn)經(jīng)營者或者農業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營服務的提供者、利用者,自愿聯(lián)合、民主管理的互助性經(jīng)濟組織?！蓖瑫r在第三條用列舉的方式明確農民專業(yè)合作社可以開展以下一種或者多種業(yè)務：農業(yè)生產(chǎn)資料的購買、使用；農產(chǎn)品的生產(chǎn)、銷售、加工、運輸、貯藏及其他相關服務；農村民間工藝及制品、休閑農業(yè)和鄉(xiāng)村旅游資源的開發(fā)經(jīng)營等；與農業(yè)生產(chǎn)經(jīng)營有關的技術、信息、設施建設運營等服務。
現(xiàn)實中的農民合作組織有很多種，農民專業(yè)合作社只是其中的一部分。只有具備本法定義中明確規(guī)定的“家庭承包經(jīng)營基礎上”“自愿聯(lián)合”“民主管理”“互助性經(jīng)濟組織”特征的農民合作組織才是本法調整范圍內的農民專業(yè)合作社，其設立、登記及運行等受本法規(guī)范的同時也享受本法規(guī)定的各項扶持措施。 其他的農民合作組織，如農村集體經(jīng)濟組織改革后成立的社區(qū)性的股份經(jīng)濟合作社或經(jīng)濟合作社，雖然這此合作社也是農民辦的，其作為我國農村集體經(jīng)濟的組織載體，在農村集體產(chǎn)權制度改革和發(fā)展壯大農村集體經(jīng)濟過程中發(fā)揮著重要作用，但不是本法所稱的農民專業(yè)合作社。再比如專門從事金融業(yè)務的農村合作金融組織以及其他以單純提供專業(yè)技術中介指導服務、行業(yè)自律服務、文化活動等為主要內容的合作組織都不是本法的調整對象。
（二）保障農民專業(yè)合作社享有與其他市場主體平等地位
法律地位農民專業(yè)合作社經(jīng)過十年的發(fā)展，雖然數(shù)量增長較快，但是大部分合作社還停留在較為初級的階段，與市場的談判能力較弱，社會認可程度較差。實踐中，一些農民專業(yè)合作社在生產(chǎn)經(jīng)營中遇到一些不平等的待遇，如在向公司投資、獲得銀行貸款、從事農產(chǎn)品深加工以及其產(chǎn)品進入超市銷售等方面存在諸多限制，出現(xiàn)這一現(xiàn)象的根本原因，是沒有把農民專業(yè)合作社當作真正的市場主體。為此，新修訂的農民專業(yè)合作社法專門增加了相應規(guī)定：新法第七條第一款規(guī)定，國家保障農民專業(yè)合作社享有與其他市場主體平等的法律地位；第十八條規(guī)定，農民專業(yè)合作社可以依法向公司等企業(yè)投資，以其出資額為限對所投資企業(yè)承擔責任。同時在第十六條規(guī)定，符合條件的農民專業(yè)合作社可以向工商行政管理部門申請頒發(fā)營業(yè)執(zhí)照，登記為農民專業(yè)合作社法人。
(三)明確成員可以用土地經(jīng)營權等財產(chǎn)以及章程規(guī)定的其他方式作價出資
農村承包土地所有權、承包權、經(jīng)營權“三權分置”是黨中央作出的重大決策，是繼家庭聯(lián)產(chǎn)承包責任制后農村改革又一重大制度創(chuàng)新，是完善農村基本經(jīng)營制度的一個重要內容。目前，農村已有30%以上的承包農戶在流轉承包地，其中流轉入合作社的面積占耕地流轉面積明20%以上。隨著農村家庭承包經(jīng)營制度進一步完善，以土地經(jīng)營權出資參加專業(yè)合作社的現(xiàn)象越來越普遍。為適應農民財產(chǎn)多樣化和土地承包經(jīng)營權“三權分置”制度的確立，平衡農民承包土地財產(chǎn)權利的實現(xiàn)與農村社會穩(wěn)定之間的關系，新修訂的農民專業(yè)合作社法增加了農民專業(yè)合作社成員可以用農村土地經(jīng)營權作價出資的規(guī)定。此外，考慮到現(xiàn)實中許多合作社發(fā)展要靠能人帶動，應當鼓勵具有經(jīng)營管理經(jīng)驗和生產(chǎn)技術的人員加入合作社，實踐中農民的出資方式多種多樣，法律應當留有一定空間，賦予農民專業(yè)合作社更大的靈活度，出資只要符合章程規(guī)定，全體成員認可、不違反法律法規(guī)的規(guī)定即可，同時法律還規(guī)定以實物等非貨幣方式出資的應當作價，以明確出資成員的責任限額。因此，新法第十三條規(guī)定:“農民專業(yè)合作社成員可以用貨幣出資，也可以用實物、知識產(chǎn)權、土地經(jīng)營權、林權等可以用貨幣估價并可以依法轉讓的非貨幣財產(chǎn)，以及章程規(guī)定的其他方式作價出資；但是，法律、行政法規(guī)規(guī)定不得作為出資的財產(chǎn)除外?！?/p>
(四)確立農民專業(yè)合作社聯(lián)合社的法人地位
隨著農民專業(yè)合作社的發(fā)展，設立或者加入聯(lián)合經(jīng)濟組織的意愿日漸強烈。目前，全國已有農民專業(yè)合作社聯(lián)合社7200多家，涵蓋農民專業(yè)合作社9.4萬多個，帶動農戶超過560萬戶。聯(lián)合社的發(fā)展不僅增強了專業(yè)合作社的發(fā)展能力，更推動了農業(yè)規(guī)?；?jīng)營，加快了現(xiàn)代農業(yè)建設步伐，但由于缺乏國家法律依據(jù)，一定程度上影響了聯(lián)合社的進一步發(fā)展。為此，新修訂的農民專業(yè)合作社法增加一章，對農民專業(yè)合作社聯(lián)合社作了規(guī)范，賦予其法人地位，明確聯(lián)合社應當是經(jīng)營實體，只有農民專業(yè)合作社才能成為聯(lián)合社的成員，對其與農民專業(yè)合作社不同的注冊登記、組織機構、治理結構、盈余分配等問題作了規(guī)定。新法第五十六條至第六十二條規(guī)定，三個以上的農民專業(yè)合作社在自愿的基礎上，可以出資設立農民專業(yè)合作社聯(lián)合社，依照本法登記,取得法人資格，領取營業(yè)執(zhí)照，登記類型為農民專業(yè)合作社聯(lián)合社；聯(lián)合社以其全部財產(chǎn)對該社的債務承擔責任，聯(lián)合社成員以其出資為限對聯(lián)合社承擔責任；聯(lián)合社應當設立由全體成員參加的成員大會，不設成員代表大會；聯(lián)合社的成員大會選舉和表決，實行一社一票;聯(lián)合社成員退社，應當在會計年度終了的六個月前書面提出。上述內容均為農民專業(yè)合作社聯(lián)合社的特別規(guī)定，是與普通農民專業(yè)合作社不同之處，對于其他本法沒有作特別規(guī)定的有關農民專業(yè)合作社聯(lián)合社的事項，依照第六十三條的規(guī)定，適用本法關于農民專業(yè)合作社的規(guī)定。
(五)進一步規(guī)范農民專業(yè)合作社的組織和行為,促進合作社由粉量型向質量型發(fā)展
截至2017年年底，全國登記注冊的農民專業(yè)合作社達201.7萬余家。但是，這其中有一部分是“空殼社”“掛牌社”，還有一部分運行得不規(guī)范。為更好地發(fā)揮法律對農民專業(yè)合作社規(guī)范發(fā)展的引導作用，新修訂的農民專業(yè)合作社法在規(guī)范農民專業(yè)合作社的組織和行為方面作了補充完善:
1.在農民專業(yè)合作社章程應當載明的事項中增加成員出資的轉讓、繼承、擔保和附加表決權的設立、行使方式和行使范圍。(第十五條)
2.增加規(guī)定，農民專業(yè)合作社應當按照國家有關規(guī)定，向登記機關報送年度報告，并向社會公示。(第十七條)
3.明確成員的入社程序。申請者應當向理事長或者理事會提出書面申請，經(jīng)成員大會或者成員代表大會表決通過后，成為本社成員。(第二十四條)
4.增加成員的除名規(guī)定。農民專業(yè)合作社成員不遵守農民專業(yè)合作社的章程、成員大會或者成員代表大會的決議，或者嚴重危害其他成員及農民專業(yè)合作社利益的，可以予以除名。成員的除名，應當經(jīng)成員大會或者成員代表大會表決通過。在實施除名時，應當為該成員提供陳述意見的機會。 被除名成員的成員資格自會計年度終了時終止。(第二十六條)
5.完善成員代表大會的人數(shù)限制。依法設立成員代表大會的，成員代表人數(shù)一般為成員總人數(shù)的百分之十，最低人數(shù)為五十一人。（第三十二條）
6.增加農民專業(yè)合作社的市場競爭退出機制。明確規(guī)定農民專業(yè)合作社連續(xù)兩年未從事經(jīng)營活動的，吊銷其營業(yè)執(zhí)照。(第七十一條)
(六)進一步明確了政府職責
對農民專業(yè)合作社的建設和發(fā)展給予指導、扶持和服務，涉及多個政府部門和單位。只有把各個部門的扶持和服務措施統(tǒng)籌起來，形成合力，才能更好地鼓勵、支持和引導農民專業(yè)合作社發(fā)展。2013年，全國農民合作社發(fā)展部際聯(lián)席會議制度正式建立。多數(shù)地方政府也相繼建立了農民專業(yè)合作社工作的綜合協(xié)調機制，統(tǒng)籌指導、協(xié)調、推動農民專業(yè)合作社的建設和發(fā)展，有力地促進了農民專業(yè)合作社的健康發(fā)展。這次修法，將這一實踐檢驗的成熟做法上升為法律制度，新法第十一條明確要求縣級以上人民政府應當建立農民專業(yè)合作社工作的綜合協(xié)調機制，統(tǒng)籌指導、協(xié)調、推動農民專業(yè)合作社的建設和發(fā)展。各級人民政府應當按照法律規(guī)定，盡快建立完善農民專業(yè)合作社工作的綜合協(xié)調機制，把統(tǒng)籌指導、協(xié)調、推動農民專業(yè)合作社的建設和發(fā)展作為實現(xiàn)鄉(xiāng)村振興戰(zhàn)略的重要抓手，保護農民專業(yè)合作社及其成員的合法權益，推進農業(yè)農村現(xiàn)代化。此外，新法還對政府部門間的信息共享作了規(guī)定，例如第十六條規(guī)定，工商行政管理機關應當將農民專業(yè)合作社的登記信息通報同級農業(yè)等有關部門。
此外，為了進一步鼓勵、支持、引導農民專業(yè)合作社的發(fā)展，新修訂的農民專業(yè)合作社法還充實了對農民專業(yè)合作社的扶持措施，例如增加了鼓勵農民專業(yè)合作社依法開展互助保險，以及對農民專業(yè)合作社用電、用地的扶持措施等。
